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博濟醫(yī)藥科技股份有限公司
股票代碼為(300404)創(chuàng)建于2002年,2015年在深圳創(chuàng)業(yè)板上市,是一家為國內(nèi)外醫(yī)藥企業(yè)提供藥品、保健品、醫(yī)療器械研發(fā)與生產(chǎn)全流程“一站式”外包服務(wù)(CRO)的型高新技術(shù)企業(yè),同也提供藥品上市許可持有人(MAH)服務(wù)。
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公司擁有近3000平米的現(xiàn)代化辦公場所,匯聚了超1000名經(jīng)驗豐富,學(xué)識淵博,思維敏捷的中高級醫(yī)藥研究人才和注冊法規(guī)專家。
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博濟醫(yī)藥始終堅持“誠實、守信、專業(yè)、權(quán)威”的經(jīng)營理念,截至2020年,公司累計為客戶提供臨床研究服務(wù)800余項,基本涵蓋了藥物治療的各個專業(yè)領(lǐng)域;累計完成臨床前研究服務(wù)500多項。經(jīng)過近二十年的發(fā)展,博濟醫(yī)藥在技術(shù)實力、服務(wù)質(zhì)量、服務(wù)范圍、營業(yè)收入、團隊建設(shè)等方面都已躋身我國CRO公司的領(lǐng)先位置,成為我國本土大型CRO公司的龍頭企業(yè)。
公司新聞
袁來如此|大分子生物分析概論(一):大分子藥物生物分析的基礎(chǔ)知識
作者:廣州博濟醫(yī)藥 時間:2021-01-20 來源:生物制藥小編

隨著國家鼓勵新藥研發(fā)、藥品審評審批制度改革的快速推進,化藥注冊分類、上市許可持有人制度等重磅政策的陸續(xù)出臺,我國新藥研發(fā)迎來暖春。對于力圖在創(chuàng)新藥領(lǐng)域深耕的從業(yè)者而言,如何洞悉全局,乘勢而為,或?qū)⒊蔀槲磥沓蓴〉年P(guān)鍵。


為此,廣州博濟醫(yī)藥微信公眾號特邀生物分析專家、博濟醫(yī)藥子公司深圳博瑞副總經(jīng)理袁智博士,開設(shè)“袁來如此”專欄,就大分子生物分析、藥代動力學(xué)等相關(guān)話題展開專題研究,希望通過相關(guān)知識與經(jīng)驗的分享,引發(fā)更多讀者的討論交流,加速振興中國的生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展,敬請垂注!


本文為“袁來如此”專欄的第一篇,旨在根據(jù)已發(fā)表的文獻資料,對與大分子生物分析相關(guān)的知識進行系統(tǒng)地介紹。


1. 生物分析中LBA測試方法的概述

配體結(jié)合式測試方法(LBA,也稱為immunoassays)是一種常用的分析工具,用于根據(jù)與其他生物分子的相互結(jié)合作用(binding interaction),定量測定生物分子(目標分析物,Analyte)在生物體液中的濃度。LBA要求至少使用一個生物分子來定量目標分析物,這個生物分子通常被稱為關(guān)鍵試劑,須能夠特異性地結(jié)合目標分析物。

LBA可分為兩大類:(1)液相結(jié)合測試,其目標分析物與標記過的檢測試劑之間的結(jié)合反應(yīng)發(fā)生在溶液相(圖1A);(2)固相結(jié)合測試,其中一個關(guān)鍵試劑被固定到固體表面,如微孔板或樹脂(圖1B),以捕獲樣本中的目標分析物。液相測試通常需要分離步驟,如色譜或電泳或離心,從而將目標分析物-標記檢測試劑從未結(jié)合的分子中分離出來進行定量。

在應(yīng)用上,LBA是重要的評估生物藥PK/TK時的主要定量分析方法之一,該方法的特異性和選擇性取決于目標分析物與其他生物分子(如受體、針對候選生物藥的抗體和核酸適配體(aptamer))的相互作用。

該方法中可觀察到儀器響應(yīng)與生物藥的濃度間接相關(guān),簡言之,檢測信號的來源是酶化學(xué)反應(yīng)或放射化學(xué)反應(yīng),而這些反應(yīng)則是各種相互結(jié)合作用(binding interactions)的一部分。

一般而言,大分子的物理化學(xué)特性無法直接產(chǎn)生檢測信號,不能用于這樣的定量分析方法。主要原因在于這些binding interactions的內(nèi)在性質(zhì),LBA的標(校)準曲線的動態(tài)(定量)范圍比較狹窄,同時也是非線性,S型的(sigmoidal curve)。

圖 1.使用放射性標記檢測試劑的液相(A)和固相(B)結(jié)合測試的原理圖

如圖1所示,在液相測試中,結(jié)合反應(yīng)在溶液中發(fā)生,其中一個目標分析物與標記過的檢測試劑結(jié)合,然后再通過后續(xù)的分離操作將目標分析物-標記檢測試劑從未結(jié)合的分子中分離出來。

在固相測試中,一個關(guān)鍵試劑被固定到固體表面,如微孔板或樹脂,此試劑在固體表面結(jié)合目標分析物,從而致使未結(jié)合的分子被分離出來。

2.放射免疫測定方法的誕生

Yalow和 Benson于1960年開發(fā)的測定人類胰島素的方法,是放射免疫測定(RIA)的標志性例子,Yalow因此于1977年獲得諾貝爾獎。簡單地說,就是通過用魚精蛋白鋅牛胰島素或商業(yè)常規(guī)牛胰島素免疫豚鼠,以獲得作為該RIA方法關(guān)鍵試劑的胰島素結(jié)合抗體。

圖 2. Yalow最初發(fā)明的胰島素放射免疫測定的原理圖

在這種方法中,由于缺乏人類胰島素的結(jié)晶體,因此I131標記的結(jié)晶牛胰島素(胰島素-I131)被用作示蹤劑。此 RIA 的原理是基于樣本中的人胰島素與豚鼠血清中的胰島素結(jié)合抗體的強力結(jié)合(圖2中的步驟1),并讓已知濃度的胰島素-I131與該抗體的結(jié)合競爭(圖2步驟2-3)。胰島素-I131與胰島素結(jié)合抗體的結(jié)合在溶液中進行,游離的胰島素-I131與結(jié)合了抗體的胰島素-I131的分離通過紙色譜電泳技術(shù)實現(xiàn),這就使得定量測定胰島素-I131成為可能,其代表了樣本中胰島素的濃度。在此方法中,最低可定量的胰島素濃度為1.4μU。

在這個有里程碑意義的研究發(fā)表之后,RIA在20世紀后期得到了廣泛的應(yīng)用。在使用適當?shù)年P(guān)鍵試劑時,RIA靈敏度和選擇性都極高,而其主要挑戰(zhàn)包括使用和處置放射性材料的許可證要求、放射性同位素的標記效率、成本及其有限的半衰期。在RIA得到應(yīng)用的十年內(nèi),即20世紀的70年代初,就出現(xiàn)了非同位素免疫測定,如酶免疫測定(enzyme immunoassays,EIA),EIA通常被稱為ELISA,即酶聯(lián)免疫吸附試驗(enzyme linked immunosorbent assay)。

Engvall和Perlmann在1971年首次描述了一個定量兔免疫球蛋白G(兔IgG)的ELISA方法。其實質(zhì)就是從羊血清中提取的抗兔IgG用于結(jié)合兔子IgG,進而結(jié)合了一種堿性磷酸酶(ALP)的兔IgG被用來與兔IgG相互競爭和抗兔IgG血清的結(jié)合,以此建立濃度與儀器響應(yīng)(信號)之間的關(guān)系,生成的儀器信號與樣本中的IgG量成反比。隨著技術(shù)的不斷發(fā)展,學(xué)界運用了不同的酶,如辣根過氧化物酶(HRP)、β-半乳糖苷酶(GAL)和熒光素酶(luciferase),使得EIA具有與RIA相當?shù)撵`敏度。


圖 2. Yalow最初發(fā)明的胰島素放射免疫測定的原理圖。樣本中的胰島素在溶液中與抗胰島素血清結(jié)合(步驟1),然后把已知濃度的I131標記的牛胰島素添加到反應(yīng)溶液中(步驟2),樣本中的胰島素與I131標記的牛胰島素(步驟3)相互競爭與抗體的結(jié)合。使用人胰島素制備的標準曲線以及胰島素抗體結(jié)合的I131標記牛胰島素的濃度可以計算樣本中被置換的胰島素的濃度。

3.常見的ELISA格式

競爭式ELISA格式是基于初始的胰島素RIA和IgG EIA方法中的結(jié)合競爭。來自樣品的目標分析物(analyte)和參照分析物(reference analyte)與分析物特異性的抗體結(jié)合之間的競爭是這種格式的關(guān)鍵。

圖3. 競爭式(Ai & Aii)、直接(B)和間接(C)ELISA測試格式的原理圖

抗體或目標分析物都可以標記酶,并用于結(jié)合反應(yīng)。使用標記抗體(圖3Ai)時,參照分析物首先被動地吸附到微孔板的孔中,然后加入含有目標分析物的樣本,如細胞裂解液、血清等,并與固定濃度的標記抗體一起孵育。樣本中的目標分析物與固定的分析物競爭,以結(jié)合有限數(shù)量的標記抗體,隨后的酶反應(yīng)產(chǎn)生的信號與樣本中目標分析物的濃度成反比。或者,可以使用固相吸附的抗體和標記分析物(圖3Aii),樣本中的目標分析物與固定數(shù)量的標記分析物共同孵育,并與之相互競爭和固定抗體的結(jié)合。與前面的示例中一樣,生成的信號與樣本中目標分析物的濃度成反比。


直接式ELISA是最簡單的ELISA格式,樣品中的目標分析物吸附到微孔板的孔中,通過酶偶聯(lián)試劑或標記檢測抗體,直接實現(xiàn)目標分析物的檢測,如圖3B所示。


圖3. 競爭式(Ai & Aii)、直接(B)和間接(C)ELISA測試格式的原理圖。目標分析物(Analyte)代表被測定的目標蛋白質(zhì)。在競爭式ELISA中,可以標記目標分析物或抗體,而在直接或間接ELISA格式中,只標記檢測抗體。

間接ELISA類似于直接ELISA,兩者間主要差別在于主要(primary)抗體未被標記。目標分析物的檢測是通過再次添加一個酶偶聯(lián)試劑或標記檢測抗體,使其與主要抗體結(jié)合而實現(xiàn)的,如圖3C 所示。

直接ELISA更快速,因為它比間接ELISA少一個步驟。它通常用于需要快速完成的常規(guī)測試,商業(yè)化的家用懷孕測試就是這種格式的一個例子。而間接ELISA雖然較直接ELISA多一個步驟,但信號放大通常優(yōu)于直接ELISA。因此,間接ELISA通常比直接ELISA更敏感,可以測量更低豐度的蛋白質(zhì)。

正如圖3C 所示,間接ELISA較直接ELISA增加的步驟正是來自于樣本的目標分析物直接吸附到微孔板,但想要達到這樣的效果,亦有一定的難度。因為在洗板步驟中,可能會洗掉目標分析物,因此可能會增加測試的變異性。此外,非特異性地結(jié)合到微孔板的其它蛋白可能導(dǎo)致假陽性結(jié)果。為了克服上述挑戰(zhàn),其它可靠性更高的格式進而衍生出來,其中有通常被稱為夾心、橋聯(lián)或競爭性ELISA(在夾心或橋聯(lián)ELISA格式中),在這些格式中,一種能與目標分析物特異性結(jié)合的生物試劑首先被吸附到微孔板中。

圖4. 夾心式ELISA(A)和橋接式(B)ELISA的原理圖


夾心式ELISA需要兩個不同的試劑或抗體,一個用于捕獲,另一個用于檢測目標分析物。這些試劑與目標分析物的不同表位(epitopes,結(jié)合位點)結(jié)合,從而形成夾心式格式(圖4A),由此產(chǎn)生的相互作用具有特別高的特異性(因為捕獲和檢測步驟都需要特異的表位識別,才能生成檢測信號)。

橋聯(lián)ELISA常用于測定具有兩個相同抗原結(jié)合位點(2價)的抗體或其它目標分析物的濃度,可以標記與捕獲相同的試劑,用于檢測一個二價的目標分析物,因此,目標分析物可被視為捕獲和檢測試劑之間的橋梁(圖 4B)。夾心或橋接ELISA 格式均可設(shè)計成為競爭式的ELISA。


圖5. 競爭式ELISA的詳細原理和流程圖。抗原競爭式ELISA(a),抗體競爭式 ELISA(b)

上述格式是ELISA的基本設(shè)計,所有格式都可以使用競爭或抑制條件加以調(diào)整,來測定抗原或抗體(圖5),所有方法都要求與試劑預(yù)先反應(yīng)/孵育才能達到最佳狀態(tài)。這些最佳狀態(tài)可以通過添加抗原(圖5a)或抗體(圖5b)來給予挑戰(zhàn)。隨著溶液中游離的抗原(抗體)的增加,能夠與固定底物(immobilized substrate)結(jié)合的抗體(抗原)的數(shù)量則減少。洗滌步驟后,添加生色劑底物(chromophore substrate)以產(chǎn)生信號(顏色變化或發(fā)光)??贵w/抗原挑戰(zhàn)引起的信號變化揭示了有關(guān)競爭性抗原/抗體的信息。競爭式ELISA對于測定復(fù)雜混合物中的抗原濃度相當有用,特別是在可能含有抗原的未知樣品與含有已知數(shù)量的純化抗原的類似樣品時。

4.LBA方法中的關(guān)鍵分析試劑
關(guān)鍵術(shù)語
  • 免疫表位(Epitope)

免疫表位(epitope)是宿主免疫系統(tǒng)一般能夠識別的抗原分子的一部分。當抗原的表位以非共價鍵的形式與其所誘導(dǎo)產(chǎn)生的抗體的確定互補性的區(qū)域(complementarity determining region)相互作用時,就會發(fā)生特異性的識別。


  • 親和力(Affinity)

抗體親和力(affinity)表示抗體與其單一目標分析物(analyte)/抗原(antigen)結(jié)合的烈度(intensity)或強度(strength),由解離常數(shù)(Kd)代表。低親和力抗體與抗原結(jié)合弱,容易解離;而高親和力抗體與抗原結(jié)合非常強,在多次的洗滌步驟中不易解離。從ELISA的角度來看,后者是首選,通常用于捕獲目標分析物。


  • 親和度(Avidity)

親和度(Avidity)是衡量一個抗體與多個抗原決定因子(antigenic determinants)結(jié)合的整體強度的指標??贵w對某一個結(jié)合位點的親和力并不總是能反映抗體-抗原相互作用的強度,例如免疫球蛋白G(IgG)有兩個抗原結(jié)合位點(2價),而IgM有10個抗原結(jié)合位點(10價),親和度表示IgG或IgM的,分別對于2個或10個抗原分子的整體結(jié)合強度(overall strength)。


關(guān)鍵試劑

一個ELISA方法最重要的組成部分是測試試劑,它決定了ELISA方法的靈敏度、特異性和方法的質(zhì)量。ELISAs常用于藥物開發(fā):在PK評估中,定量測定蛋白生物藥的濃度;測定內(nèi)源性蛋白和生物標志物;檢測抗藥物抗體的存在以進行免疫原性評估等。LBA方法首選的關(guān)鍵試劑是單克隆抗體(MAbs)或多克隆抗體(PAbs),而不是重組靶標蛋白。為了產(chǎn)生PAbs或MAbs,需要將生物藥或生物標志物蛋白及其佐劑或載體,根據(jù)相關(guān)應(yīng)用給到合適的宿主動物物種上進行免疫。對于PAbs,兔子、山羊和綿羊是最常用的宿主物種,因為它們的體型大(產(chǎn)生的抗體量也大),容易找到血管和強健的免疫反應(yīng)。

用于免疫的每一個抗原都是高度復(fù)雜的,因為它可以呈現(xiàn)大量的,可以被不同的淋巴細胞識別的表位,這些淋巴細胞隨后被激活。激活了的淋巴細胞增殖,分化成漿細胞,并分泌出多克隆抗體的混合體。PAb庫(混合體)代表了不同抗體的集合群體,這些抗體可以識別抗原的多個表位(用于ELISA分析)。為了生產(chǎn)MAbs,需要進一步分離單個淋巴細胞,并與骨髓瘤細胞融合,以產(chǎn)生不死的雜交瘤細胞,從而持續(xù)產(chǎn)生特定的MAb。因此,同一個克?。╟lone)的抗體只識別一個抗原的單個表位。在ELISA中會頻繁使用MAbs或PAbs,其選擇(對于每種ELISA格式而言)取決于許多考慮因素:如可及性(Availability)、親和力、特異性(Specificity)和交叉反應(yīng)性(Cross-reactivity)。

  • 特異性(Specificity)和交叉反應(yīng)性(Cross-Reactivity)

抗體的特異性(specificity)是特異性地結(jié)合相關(guān)抗原的能力,與ELISA方法的選擇性(selectivity)不盡相同,但相關(guān)。選擇性是一個定量分析方法,在其它潛在干擾成分存在的情況下,從眾多其它無關(guān)的蛋白質(zhì)中鑒別和定量測定目標分析物濃度的能力。交叉反應(yīng)性(cross-reactivity)是指抗體與除目標抗原之外的其它多個抗原結(jié)合的能力。當抗原(目標分析物)的與抗體試劑結(jié)合的表位與其它蛋白質(zhì)相似時就會發(fā)生交叉反應(yīng)。一般來說,特異性和交叉反應(yīng)性對ELISA方法的選擇性和基質(zhì)效應(yīng)有很大影響。如果使用高親和力抗體作為捕獲試劑,抗體/目標分析物的復(fù)合物就能夠在含有多種蛋白質(zhì)的“混合物”樣品中有效地形成,基質(zhì)效應(yīng)會隨之降低,而方法的選擇性最終會得到提升。

5.ELISA在蛋白生物藥開發(fā)中的應(yīng)用

表1.用于 PK、生物標志物和免疫原性測試的常用試劑和首選測試格式

表1總結(jié)了ELISA可能用到的試劑和各種通用或首選格式。

PK測試方法

測試試劑的可及性可能因藥物開發(fā)的不同階段而異。在早期探索階段,可能無法得到MAbs或PAbs,故常常選擇重組生產(chǎn)的配體(即生物藥的靶點)作為關(guān)鍵試劑來測定游離的蛋白生物藥(therapeutic protein,TP)的濃度。在早期臨床前研究中,針對IgG Fc部分的通用抗體可用于單克隆抗體藥物,盡管僅能測定總濃度(結(jié)合靶標后的TP +游離的TPf)。

生物標志物的定量分析方法

各種體外診斷試劑盒在商業(yè)上可用于藥物的早期發(fā)現(xiàn)階段,也可從不同的供應(yīng)商獲得各種重組蛋白和抗生物標記物蛋白的抗體。雖然生物標記物的定量分析方法與PK方法相似,但這二者之間存在明顯差別。與PK方法類似,生物標志物的定量分析方法可用于測定目標基質(zhì)中生物標志物蛋白的游離濃度或總濃度。夾心式測試格式是主要選擇,通常用于測定生物標志物蛋白的游離或總濃度。雖然當一個生物藥具有抑制作用時,需要測量游離的生物標志物蛋白濃度,但開發(fā)測定游離的生物標志物蛋白的方法有相當?shù)奶魬?zhàn)性,可能需要額外的分離步驟。

免疫原性測試方法

人源化的或全人源的單克隆抗體或重組蛋白,作為藥物給予受試者/動物后,可誘導(dǎo)形成針對該生物藥的抗體,特別是在臨床前的動物試驗中,這些由生物藥誘導(dǎo)而形成的抗體通常被稱為抗藥物抗體(ADA)。免疫檢測方法是檢測ADA是否存在于血清中的第一級檢測。不同的ADA反應(yīng),如表位特異性(idiotype vs. nonidiotype,特異與非特異性)和數(shù)量(滴度或相對濃度),會影響對ADA和生物藥的準確定量。由于ADAs會在血液循環(huán)中與生物藥形成免疫復(fù)合物,高濃度的蛋白生物藥能夠干擾ADA的檢測。

備注:idiotype:免疫球蛋白(如IgG)可變區(qū)域的分子結(jié)構(gòu)和構(gòu)象,賦予其抗原特異性。


6.LBA定量分析方法的優(yōu)點和缺點

LBA測試方法在各種生物分子的定量分析方面擁有各種優(yōu)勢。它們在大多數(shù)平臺(如比色計或平面電化學(xué)發(fā)光)上,成本通常很低。當高親和力MAbs用于LBAs時,LBA方法在檢測和定量分析存在于異質(zhì)性的基質(zhì)環(huán)境中的目標分析物方面,具有高度靈敏度和特異性。出于研究目的,該類方法的靈敏度可以低至每毫升毫微微克的級別(femtogram/mL)。大多數(shù)LBAs的操作程序不涉及樣品分離的步驟,而基于LC-MS/MS的定量分析方法則需要。當然,LBA也有幾個缺點,與LC-MS/MS方法相比,LBA方法的動態(tài)范圍較狹窄。雖然用于基礎(chǔ)研究的方法可以達到4-6個指數(shù)級的動態(tài)范圍,但用于規(guī)范性研究(regulated study)的驗證過的方法,其定量范圍往往僅為2-3個指數(shù)級,這是因為必須保持方法的穩(wěn)健性和更好的重現(xiàn)性。


最重要的區(qū)別是,LBA的性能取決于所使用試劑的質(zhì)量和特異性。因此,試劑生成/選擇(MAbs或PAbs)是方法開發(fā)過程中的關(guān)鍵步驟,這可能非常耗時,3到9個月不等。當使用分析物特異性的試劑來捕獲目標分析物時,這個缺點對LC-MS/MS方法也是存在的。從生物標志物方法的角度來看,試劑的交叉反應(yīng)可導(dǎo)致該方法的非特異性。因此,強烈建議進行額外的測試以闡明試劑的交叉反應(yīng)性和非特異性。


7.結(jié)論與未來展望

本文概述了LBA測試方法,包括其主要概念的起源和演變,并且回顧了常用的大分子生物分析方法的測試格式。最初的LBA測試方法誕生于1960年,是為測定胰島素而開發(fā)的放射免疫測試(radioimmunoassay),LBA測試方法的基礎(chǔ)是至少有一種蛋白質(zhì)與感興趣的目標分析物有相互作用。在當今的實驗室, 酶免疫測試(enzyme immunoassay)已在很大程度上取代了放射性免疫測試,成為了LBA測試方法的首選形式。


此外,本文還介紹了其它各種測試格式,如競爭式(competitive)、夾心式(sandwich)和橋接式(bridging),以及其所需的關(guān)鍵試劑。最后,簡明扼要地討論了LBA測試方法在蛋白質(zhì)生物藥開發(fā)中的應(yīng)用,以及與其它生物分析平臺的比較。


自上世紀60年代對胰島素進行定量測定以來,基于與其它生物分子結(jié)合作用的LBA方法已被廣泛地用于生物分子的定量分析。例如,在蛋白質(zhì)生物藥開發(fā)過程中,這些方法為定量分析或檢測蛋白質(zhì)提供了一種準確和經(jīng)濟有效的方法。測試試劑(MAbs或PAbs)生成/選擇是LBA方法開發(fā)過程中的關(guān)鍵步驟,一旦選擇好了試劑,不同測試平臺上的LBA方法能夠提供顯著節(jié)約時間和經(jīng)濟成本。


如前所述,另一個主要的大分子生物分析平臺是液相色譜-質(zhì)譜(LC-MS/MS)。在小分子藥物的生物分析中,LC-MS/MS方法是毋庸置疑的王者,在大分子分析中,LC-MS/MS的重要性也在不斷地增加,特別是在與LBA方法以某種形式組合之后??梢钥隙ǎ锓治鰳I(yè)界將繼續(xù)探索LC-MS/MS在蛋白質(zhì)藥物的生物分析中的應(yīng)用。生物分析行業(yè)必須證明LC-MS/MS在藥物開發(fā)的整個過程中,與LBA方法相比較,具有重現(xiàn)性(reproducibility)、可轉(zhuǎn)移性(transferability)、可靠性(reliability)和成本效益(cost–effectiveness)等方面的顯著優(yōu)勢。本系列后續(xù)將介紹相關(guān)知識,敬請關(guān)注。

本文來源:生物制藥小編

特別聲明

本文如有疏漏和誤讀相關(guān)指南和數(shù)據(jù)的地方,請讀者評論和指正。所有引用的原始信息和資料均來自已經(jīng)發(fā)表學(xué)術(shù)期刊、官方網(wǎng)絡(luò)報道等公開渠道, 不涉及任何保密信息。參考文獻的選擇考慮到多樣化但也不可能完備。歡迎讀者提供有價值的文獻及其評估。

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